Beaucoup de plasmides portent par exemple des gènes résistant à certains antibiotiques. Les bactéries qui possèdent de tels plasmides sont alors protégés contre ces antibiotiques. A l'aide du génie génétique, on peut transférer des gènes sur une plante qui la munissent d'une résistance contre les virus, les champignons, les insectes ou les nématodes.